Permissão para webservice war gravar

Olá pessoal, estou com uma dúvida:

Eu desenvolvi uma aplicação .war e inseri dentro do fluig, basicamente ela realiza o download de uma arquivo, altera e salva na pasta de upload do usuário.

No windows funciona, mas no linux não.

Alguém sabe o que pode ser ?

Obs: Já dei permissoes nas pastas 777, ja inseri a aplicação no grupo e user root:root

Obrigado pela força.