Você andou alterando alguma CSS do filtro? Eu tive esse problema quando alterei o height do filter-panel e/ou tt-input.
Para resolver isso, bastava tirar essa alteração... Se isso aconteceu contigo, segue uma solução:
Ao invés de mexer no height do filter-panel e/ou tt-input, eu mexi no bootstrap-tagsinput, ai funcionou 100%.