O LP 650 é para contabilização de notas "normais" de entrada, para os casos de devolução voce deve usar o 640 ou 0 642.
Segue o link
LANÇAMENTOS PADRÕES MÓDULO COMPRAS
ONLINE OFFLINE CÓDIGO Descrição
X X 640 Entrada de NF Devolução/Beneficiamento ( Cliente ) - Itens
X X 641 Entrada de NF Devolução/Beneficiamento ( Cliente ) - Itens do Rateio
X X 642 Entrada de NF Devol.Vendas - Total (SF1)
X X 650 Entrada de NF Normal ( Fornecedor ) - Itens